JIA | 新疆畜牧科学院和福建农林大学研究团队揭示我国早期分离的小反刍动物慢病毒基因组特征

本研究使用分段扩增和测序的方法获得了1989–1994年间从我国甘肃、贵州、陕西、山东和四川等地感染奶山羊中分离的5株CAEV病毒基因组，通过基因型分析、全基因组比对、遗传进化和种群结构分析来阐释该病毒基因组特征。我国CAEV与国外毒株基因组相似度为58%–93%，属于B型小反刍动物慢病毒，可进一步归为B1基因型。遗传进化分析结果显示本研究测定的5株病毒与其它两株中国毒株聚集成簇，亲缘关系最近，同源性为98.3%–99.3%；其次是与美国毒株Clements（GenBank登录号NC_001463.1），相似性为91.8%–92.3%；种群结构分析表明我国已测定的7株病毒拥有与其它已知毒株不同的祖先成分。跨度5年从我国不同省份分离的CAEV毒株具有高度同源性，分离株可能起源于非已知毒株的其它来源。

本研究完成了我国最早分离的5株CAEV病毒的基因组测序和基因特征分析，确认我国分离毒株高度同源，可能起源于特定的同一祖先，该结果为研制适用于我国CAEV检测的试剂和CAEV流行病学调查与防控奠定了基础。

以上研究由新疆畜牧科学院兽医研究所新疆动物疫病研究重点实验室和福建省动物药物工程实验室领衔，相关研究得到了国家重点研发计划（2016YFD0500908）的资助。

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https://doi.org/10.1016/j.jia.2‍02‍2‍.‍0‍8‍‍‍‍‍.110