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JIA | 山东省花生研究所陈静课题组基于图像分析挖掘花生荚果形态稳定主效遗传位点

张胜忠 等 农业科学微平台 2023-08-24
花生(Arachis hypogaea L.),是我国重要的油料作物和经济作物,因其富含油脂(35%–60%)、蛋白质(22%–30%)及其他营养,深受消费者青睐。荚果是花生的收获器官,其“颜值”(即荚果形态)不仅是重要的品种特性,也决定了花生制品的市场价值。由于缺乏针对花生荚果形态的定量化系统评价方法,相关性状基因/QTL的定位研究进展缓慢。
近期,山东省花生研究所陈静课题组完成的题为“A stable and major QTL region on chromosome 2 conditions pod shape in cultivated peanut (Arachis hyopgaea L.)”的研究论文Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文),JIA) 2023年8期正式发表
该研究以两个花生品种(花育36号×6-13)构建的重组自交系(RIL)群体为研究材料。基于图像分析,定义了6个荚果形态组分性状,包括荚果长度、荚果宽度、荚果长宽比、荚果圆度、果喙明显度和缢缩明显度。研究发现6个组分性状存在不同程度的相关性,广义遗传率为0.87–0.95。利用前期构建的高密度遗传图谱,在3个环境下共鉴定到26个相关QTL,分别解释3.79–52.37%的表型变异。在花生第2染色体上发现一个可影响5个组分性状的稳定主效新位点,覆盖10.81 Mb物理区间,并对该区间潜在候选基因进行了预测分析。此外,还针对6个组分性状鉴定到73对上位性互作(涉及92个遗传位点),分别解释0.94–6.45%的表型变异。该研究不仅为花生荚果形态相关基因的图位克隆提供了重要研究基础,也为花生相关性状的分子遗传改良提供了新思路。


山东省花生研究所抗逆育种团队陈静研究员、苗华荣副研究员和潍坊市农科院付春研究员为该文章的共同通讯作者,张胜忠博士为改文章第一作者。该项目等到了国家自然科学基金(32001584)、山东省自然科学基金(ZR202111290099)、山东省农业良种工程(2020LZGC001)、山东省农科院创新工程(CXGC2022A21, CXGC2022A03, CXGC2023A06 (A39, A46))和青岛市科技惠民示范引导专项(20-3-4-26-nsh)的资助。


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https://doi.org/10.1016/j.ji‍a‍.‍20‍2‍3‍.02.005

Cite the article:

ZHANG Sheng-zhong, HU Xiao-hui, WANG Fei-fei, CHU Ye, YANG Wei-qiang, XU Sheng, WANG Song, WU Lan-rong, YU Hao-liang, MIAO Hua-rong, FU Chun, CHEN Jing. 2023. A stable and major QTL region on chromosome 2 conditions pod shape in cultivated peanut (Arachis hyopgaea L.). Journal of Integrative Agriculture, 22(8): 2323-2334.


专家简介


陈静研究员


山东省花生研究所抗逆育种团队由陈静研究员领衔,重点开展逆境下花生产量、品质相关性状的基因挖掘,优异抗逆种质创制,高产优质抗逆品质培育。该团队育成花生品种20余个,其中培育的高产广适出口品种花育22号、高产广适抗旱耐盐碱适机收品种花育25号、高产广适耐盐碱品种花育36号等成为我国北方花生产区主栽品种,研究结果先后获山东省科技进步二等奖、青岛市科技进步一等奖等7项,发表研究论文70余篇,获得国家发明专利2件。



Journal of Integrative Agriculture (《农业科学学报》(英文), JIA) 由中华人民共和国农业农村部主管,中国农业科学院与中国农学会主办,中国农业科学院农业信息研究所承办。综合性英文学术期刊,月刊。创刊于2002年,现任主编为中国科学院院士陈化兰。JIA主要栏目有作物科学、园艺、植物保护、动物科学、动物医学、农业生态环境、食品科学、农业经济与管理等。刊稿类型有综述、研究论文、简报以及评述等。全部论文在Elsevier-ScienceDirect (SD) 平台OA出版。最新SCI影响因子4.8,位于SCI-JCR农业综合学科Q1区。中科院分区农林科学1区。2016年以来先后获得中国科协等部委 “提升计划”“登峰计划”“卓越计划”项目支持。

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